分子生物學(xué)操作中會涉及一系列儀器,使用不當(dāng)導(dǎo)致實驗失敗、減少儀器使用壽命或損壞儀器。
因此在進(jìn)行操作前細(xì)致地了解各種儀器的使用方法及注意事項,是使后繼實驗事半功倍的一個必要準(zhǔn)備。冷凍離心機(jī) 低溫分離技術(shù)是分子生物學(xué)研究中必不可少的手段。
基因片段的分離、酶蛋白的沉淀和回收以及其它生物樣品的分離制備實驗中,都離不開低溫離心技術(shù),因此低溫冷凍離心機(jī)已成為分子生物學(xué)研究中必需的重要工具。使用方法:1.離心機(jī)應(yīng)放置在水平堅固的地板或平臺上,并力求使機(jī)器處于水平位置以免離心時造成機(jī)器震動。
2.打開電源開關(guān),按要求裝上所需的轉(zhuǎn)頭,將預(yù)先以托盤天平平衡好的樣品放置于轉(zhuǎn)頭樣品架上(離心筒須與樣品同時平衡),關(guān)閉機(jī)蓋。3.按功能選擇鍵,設(shè)置各項要求:溫度、速度、時間、加速度及減速度,帶電腦控制的機(jī)器還需按儲存鍵,以便記憶輸入的各項信息。
4.按啟動鍵,離心機(jī)將執(zhí)行上述參數(shù)進(jìn)行運(yùn)作,到預(yù)定時間自動關(guān)機(jī)。5.待離心機(jī)完全停止轉(zhuǎn)動后打開機(jī)蓋,取出離心樣品,用柔軟干凈的布擦凈轉(zhuǎn)頭和機(jī)腔內(nèi)壁,待離心機(jī)腔內(nèi)溫度與室溫平衡后方可蓋上機(jī)蓋。
注意事項:1.機(jī)體應(yīng)始終處于水平位置,外接電源系統(tǒng)的電壓要匹配,并要求有良好的接地線。2.開機(jī)前應(yīng)檢查轉(zhuǎn)頭安裝是否牢固,機(jī)腔有無異物掉入。
3.樣品應(yīng)預(yù)先平衡,使用離心筒離心時離心筒與樣品應(yīng)同時平衡。4.揮發(fā)性或腐蝕性液體離心時,應(yīng)使用帶蓋的離心管,并確保液體不外漏,以免腐蝕機(jī)腔或造成事故。
5.擦拭離心機(jī)腔時動作要輕,以免損壞機(jī)腔內(nèi)溫度感應(yīng)器。6.每次操作完畢應(yīng)作好使用情況記錄,并定期對機(jī)器各項性能進(jìn)行檢修。
7.離心過程中若發(fā)現(xiàn)異常現(xiàn)象,應(yīng)立即關(guān)閉電源,報請有關(guān)技術(shù)人員檢修。附:相對離心力與每分鐘轉(zhuǎn)速的換算 離心機(jī)的轉(zhuǎn)速,在以前實驗資料中一般以每分鐘多少轉(zhuǎn)來表示。
由于離心力不僅為轉(zhuǎn)速函數(shù),亦為離心半徑的函數(shù),即轉(zhuǎn)速相同時,離心半徑越長,產(chǎn)生的離心力越大。因此僅以轉(zhuǎn)速表達(dá)離心力是不夠科學(xué)的,近年來主張用相對離心力(RCF)來表示比較合理。
現(xiàn)在國際資料中,已改用相對離心力來表示。兩者的互換公式如下:PCR擴(kuò)增儀:目前各公司提供的PCR儀操作方法各有不同,按其操作說明進(jìn)行操作。
值得提出的是,在使用一定時期后,樣品孔的實際溫度與儀器顯示溫度有時會有較大差異,應(yīng)當(dāng)請廠商的技術(shù)支持人員校對儀器的各項性能。數(shù)字式酸度計:一、準(zhǔn)備工作1.儀器應(yīng)平放在符合使用環(huán)境的工作臺上,依視覺角度支起支架。
3.pH值的定位測量法:(一)二點定位法(高精度測量方法)(1) 連接好電極線路,將參比電極及活化滿24h以上清潔的PH電極移入第一標(biāo)準(zhǔn)緩沖液pH1中(例pH1=4.00),待儀器響應(yīng)穩(wěn)定后,調(diào)節(jié)定位旋鈕至儀器顯示為“0.00”;(2) 將電級系統(tǒng)從第1種標(biāo)準(zhǔn)液中取出,用去離子水沖洗干凈后以濾紙吸干電級表面水份,移入第2種標(biāo)準(zhǔn)液(例pH2=9.18)中,儀器響應(yīng)穩(wěn)定后,調(diào)節(jié)斜率旋鈕,使儀器顯示為(△pH=pH1-pH2=9.18-4.00=5.18)此后斜率旋鈕不可再動,除非更換電極系統(tǒng);(3) 斜率調(diào)節(jié)完成后,重新調(diào)節(jié)定位旋鈕,使儀器顯示第2種標(biāo)準(zhǔn)液的實際pH值(9.18),至此2點定位結(jié)束;(4) 將電極從第2種標(biāo)準(zhǔn)液中取出沖洗、吸干后移入待測溶液中,儀器響應(yīng)穩(wěn)定后顯示的數(shù)值即為待測溶液的pH值。(二)一點定位法(粗略測量法)(1) 將溫度補(bǔ)償旋鈕調(diào)至溶液溫度值;(2) 向左將斜率補(bǔ)償旋鈕旋轉(zhuǎn)至頭;(3) 將電級系統(tǒng)移入標(biāo)準(zhǔn)液中(一點法僅用一種標(biāo)準(zhǔn)液,如pH=4.00時),調(diào)節(jié)定位旋鈕使儀器顯示“4.00”;(4) 取出電級沖洗吸干水分后移至待測溶液中,儀器響應(yīng)穩(wěn)定后顯示的數(shù)值即為待測溶液的pH值。
三、溫度的測量1.將功能選擇撥至溫度檔。2.將溫度探頭插入插孔,并將溫度探頭置于環(huán)境條件或溶液中,儀器響應(yīng)穩(wěn)定后儀器顯示值即為環(huán)境條件或溶液溫度值。
四、注意事項1.認(rèn)真做好儀器使用前準(zhǔn)備工作。2.儀器通電后或測量過程中出現(xiàn)顯示不穩(wěn)或亂跳現(xiàn)象,應(yīng)切斷電源進(jìn)行檢查,如電壓、預(yù)熱時間及電極系統(tǒng)等是否正常。
3.使用不同電極應(yīng)注意排除離子的干擾,選擇好鹽橋,必要時應(yīng)使用離子強(qiáng)度固定劑。4.電極系統(tǒng)從第1種溶液取出移入第2種溶液之前,須用去離子水或雙蒸水清洗干凈,再用濾紙吸干表面水分,以免影響測定結(jié)果的準(zhǔn)確性。
5. 儀器應(yīng)存放于干燥、清潔無腐蝕的場所,每次測量結(jié)束后應(yīng)關(guān)閉電源,退出電極及溫度探頭妥善保存。玻璃電極清洗后可浸于去離子水待用(注意水面不得低于玻璃球泡),甘汞電極清潔后套上橡皮帽置于配套盒中保存,當(dāng)甘汞電極內(nèi)充液泄漏或不飽和及鹽橋中斷時,應(yīng)及時補(bǔ)充飽和內(nèi)充液。
6.該類儀器均采用大規(guī)模集成電路,輸入阻值較高,在對儀器內(nèi)部進(jìn)行任何零部件修理焊接時,應(yīng)使用45W以下有良好地線的烙鐵,無接地線烙鐵應(yīng)撥下電源插頭焊接。分光光度計 不同物質(zhì)對不同波長入射光的吸收程度各不相同,從而形成特征性的吸收光譜。
分光光度法不僅適應(yīng)于可見光區(qū),同時還可擴(kuò)展至紫外光區(qū)及紅外光區(qū),因此給科研實驗帶來了極大方便。下面重點介紹分光光度計的使用及注意事項。
使用規(guī)。
目前,分子生物學(xué)飛速發(fā)展,分子生物學(xué)相關(guān)的理論和技術(shù)已深入到生命科學(xué)的各個領(lǐng)域,一些常用的技術(shù),如基因組DNA的分離純化,質(zhì)粒DNA的抽提及純化,RNA的提取,PCR擴(kuò)增,Southern blot等成為分子生物學(xué)研究的強(qiáng)有力工具,為分子生物學(xué)的發(fā)展起了巨大的推動作用,然后,這些實驗操作技術(shù)都涉及到氯仿、DEPC、同位素等有毒有害或具放射性的物質(zhì),對環(huán)境和人身安全也造成巨大的威脅。因此,弄清這些有害有毒物質(zhì)的作用,加強(qiáng)實驗室安全管理,建立良好的制度和處理,保證分子生物學(xué)實驗室成為真正的科研陣地。
放射性物質(zhì)的處理:放射性同位素技術(shù)具有靈敏、簡便和廉價等優(yōu)點,在分子生物學(xué)實驗室應(yīng)用普遍,但由于放射性同位素的輻射會給人體造成損傷,如果使用不當(dāng)或操作不規(guī)范,會造成環(huán)境污染,甚至損傷人員。在進(jìn)行同位素操作時一定要注意個人防護(hù),包括使用隔離、專用衣帽手套及防護(hù)背心、擋板等。對放射性同位素的污染進(jìn)行安全性教育,實行責(zé)任到人的做法,對放射性物質(zhì)統(tǒng)一保管、集中存放、集中處理的做法。在定購?fù)凰貢r,根據(jù)需要量進(jìn)行訂購。α-31p半衰期為14.5天,在southern blotting應(yīng)用較廣,是危害較大的放射性物質(zhì)。DNA雜交時,在探針標(biāo)記、洗膜等幾個階段都涉及同位素。對含α-31p固體廢物,放入鐵皮箱10個半衰期(約半年)后埋到指定的地點:對于含α-31p濃度較高的液體廢物(如首次洗膜液),在厚實的朔料桶放置8個半衰期后倒入專用的下水道;含α-31p濃度較低的液體廢物(如二、三次洗膜液),則直接倒入專用的下水道。
4.3常見的有毒物質(zhì)的處理:溴化乙錠、Trizol、丙烯酰氨、DEPC、甲酰氨等毒性高、環(huán)境危害大的物質(zhì),分類收集后統(tǒng)一處理。
4.3.1 EB(Ethidiunl bromide,溴化乙錠):EB是一種強(qiáng)烈誘變劑并有中度毒性,應(yīng)戴手套操作,對于含有EB的溶液也不應(yīng)直接倒下水道,用后妥善凈化處理:EB含量大干0.5μg/ml溶液先用水將EB濃度稀釋至0.5μg/ml以下,每100ml溶液加入100mg活性碳。不時輕輕搖蕩混勻,室溫放置1小時,濾紙過濾將活性碳與濾紙密封在塑料袋中作為有害廢物丟棄?;蛴脤S靡淮涡匀玖锨宄℅ene有限公司)吸附過夜,再焚燒袋子即可。EB接觸物,如抹布、槍頭等埋入地下。
4.3.2 Trizol:提取組織和細(xì)胞RNA的一種重要試劑,在提取RNA時一定要在通風(fēng)進(jìn)行。如皮膚接觸Trizol,請立即用大量去垢劑和水沖洗,廢液埋入地下。
4.3.3 DEPC(Diethylprocarbonate,二乙基焦碳酸酯):RNA酶的強(qiáng)抑制劑,一種潛在的致癌物質(zhì)。操作時戴口罩。在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。沾到手上立即沖洗,廢液通過廢液道排泄。
4.3.4 CHCl3(ChIoroform,氯仿):常用于DNA和RNA提取,對皮膚、眼睛、黏膜和呼吸道有強(qiáng)烈的刺激作用和腐蝕性,易損害肝和腎。操作時戴手套在通風(fēng)櫥里進(jìn)行,廢液收集后埋入地下。
4.3.5 Acrylamide(丙烯酰胺):DNA測序、SSR及蛋白質(zhì)分離等技術(shù)中作電泳支持物,具神經(jīng)毒性,聚合后毒性消失。操作時戴手套在通風(fēng)櫥內(nèi)進(jìn)行,聚合后的聚丙烯酰胺凝膠沒有毒性,可隨普通垃圾一起扔掉,千萬不要倒入下水道。
目前,分子生物學(xué)飛速發(fā)展,分子生物學(xué)相關(guān)的理論和技術(shù)已深入到生命科學(xué)的各個領(lǐng)域,一些常用的技術(shù),如基因組DNA的分離純化,質(zhì)粒DNA的抽提及純化,RNA的提取,PCR擴(kuò)增,Southern blot等成為分子生物學(xué)研究的強(qiáng)有力工具,為分子生物學(xué)的發(fā)展起了巨大的推動作用,然后,這些實驗操作技術(shù)都涉及到氯仿、DEPC、同位素等有毒有害或具放射性的物質(zhì),對環(huán)境和人身安全也造成巨大的威脅。
因此,弄清這些有害有毒物質(zhì)的作用,加強(qiáng)實驗室安全管理,建立良好的制度和處理,保證分子生物學(xué)實驗室成為真正的科研陣地。放射性物質(zhì)的處理:放射性同位素技術(shù)具有靈敏、簡便和廉價等優(yōu)點,在分子生物學(xué)實驗室應(yīng)用普遍,但由于放射性同位素的輻射會給人體造成損傷,如果使用不當(dāng)或操作不規(guī)范,會造成環(huán)境污染,甚至損傷人員。
在進(jìn)行同位素操作時一定要注意個人防護(hù),包括使用隔離、專用衣帽手套及防護(hù)背心、擋板等。對放射性同位素的污染進(jìn)行安全性教育,實行責(zé)任到人的做法,對放射性物質(zhì)統(tǒng)一保管、集中存放、集中處理的做法。
在定購?fù)凰貢r,根據(jù)需要量進(jìn)行訂購。α-31p半衰期為14.5天,在southern blotting應(yīng)用較廣,是危害較大的放射性物質(zhì)。
DNA雜交時,在探針標(biāo)記、洗膜等幾個階段都涉及同位素。對含α-31p固體廢物,放入鐵皮箱10個半衰期(約半年)后埋到指定的地點:對于含α-31p濃度較高的液體廢物(如首次洗膜液),在厚實的朔料桶放置8個半衰期后倒入專用的下水道;含α-31p濃度較低的液體廢物(如二、三次洗膜液),則直接倒入專用的下水道。
4.3常見的有毒物質(zhì)的處理:溴化乙錠、Trizol、丙烯酰氨、DEPC、甲酰氨等毒性高、環(huán)境危害大的物質(zhì),分類收集后統(tǒng)一處理。 4.3.1 EB(Ethidiunl bromide,溴化乙錠):EB是一種強(qiáng)烈誘變劑并有中度毒性,應(yīng)戴手套操作,對于含有EB的溶液也不應(yīng)直接倒下水道,用后妥善凈化處理:EB含量大干0.5μg/ml溶液先用水將EB濃度稀釋至0.5μg/ml以下,每100ml溶液加入100mg活性碳。
不時輕輕搖蕩混勻,室溫放置1小時,濾紙過濾將活性碳與濾紙密封在塑料袋中作為有害廢物丟棄?;蛴脤S靡淮涡匀玖锨宄℅ene有限公司)吸附過夜,再焚燒袋子即可。
EB接觸物,如抹布、槍頭等埋入地下。 4.3.2 Trizol:提取組織和細(xì)胞RNA的一種重要試劑,在提取RNA時一定要在通風(fēng)進(jìn)行。
如皮膚接觸Trizol,請立即用大量去垢劑和水沖洗,廢液埋入地下。 4.3.3 DEPC(Diethylprocarbonate,二乙基焦碳酸酯):RNA酶的強(qiáng)抑制劑,一種潛在的致癌物質(zhì)。
操作時戴口罩。在通風(fēng)櫥中進(jìn)行。
沾到手上立即沖洗,廢液通過廢液道排泄。 4.3.4 CHCl3(ChIoroform,氯仿):常用于DNA和RNA提取,對皮膚、眼睛、黏膜和呼吸道有強(qiáng)烈的刺激作用和腐蝕性,易損害肝和腎。
操作時戴手套在通風(fēng)櫥里進(jìn)行,廢液收集后埋入地下。 4.3.5 Acrylamide(丙烯酰胺):DNA測序、SSR及蛋白質(zhì)分離等技術(shù)中作電泳支持物,具神經(jīng)毒性,聚合后毒性消失。
操作時戴手套在通風(fēng)櫥內(nèi)進(jìn)行,聚合后的聚丙烯酰胺凝膠沒有毒性,可隨普通垃圾一起扔掉,千萬不要倒入下水道。
第3章 分子生物學(xué)實驗基本操作技術(shù) 這里的實驗基本操作技術(shù)是指在分子生物學(xué)實驗中使用范圍最廣、使用頻率最高、幾乎所有實驗都要應(yīng)用的技術(shù)。
器皿的清洗,試管、量筒(杯)、容量瓶、吸管及移液器、電子天平等量具的正確操作和使用、試劑配制等技術(shù),應(yīng)當(dāng)都是基本操作技術(shù),但這些內(nèi)容已在分析化學(xué)、生物化學(xué)的實驗課程中作了詳細(xì)介紹。本章主要介紹與分子生物學(xué)實驗有關(guān)的除(滅)菌技術(shù)、無菌操作技術(shù)和微量操作技術(shù)。
3.1 除(滅)菌技術(shù) 在進(jìn)行分子生物學(xué)實驗過程中,需要一個清潔的實驗環(huán)境,所使用的器皿及溶液均需要進(jìn)行除(滅)菌處理,一方面避免環(huán)境中微生物的污染,另一方面還可消除蛋白酶和核酸酶對實驗的干擾和影響。在進(jìn)行微生物及細(xì)胞的純培養(yǎng)時要求更高,不能有任何外來雜菌。
因此,對所有器材、培養(yǎng)基要進(jìn)行嚴(yán)格滅菌,對工作場所進(jìn)行消毒,保證工作順利進(jìn)行。實驗室常用的除滅菌方法主要有物理方法及化學(xué)方法兩種。
物理方法包括用濕熱(高壓蒸汽)、干熱、紫外線、過濾、離心沉淀等方法除去微生物;化學(xué)方法是使用化學(xué)消毒劑、抗菌素等殺死或抑制微生物。根據(jù)被滅菌物品的材料性質(zhì)和實驗要求,可采取不同的消毒滅菌方法。
3.1.1 物理滅菌法 (1)干熱滅菌:干熱滅菌包括火焰灼燒滅菌和熱空氣滅菌。火焰灼燒適用于金屬用具,如接種環(huán)、接種針和手術(shù)器械等,玻璃器皿的口頸,如試管口和瓶口,玻璃棒等的滅菌處理。
這種方法滅菌迅速徹底。熱空氣滅菌一般在烤箱中進(jìn)行,利用高溫干燥空氣(160℃?170℃)加熱滅菌1?2h,適用于玻璃器皿和培養(yǎng)皿等。
干熱消毒后的器皿干燥,易于保存。缺點是干熱傳導(dǎo)慢,可能有冷空氣存留于烤箱內(nèi),因此要求較高的溫度和較長的時間才能達(dá)到消毒的目的。
應(yīng)當(dāng)注意,干烤滅菌完畢后不得馬上將烤箱門打開,須等溫度降至70℃以下時再開箱門,以免冷空氣突然進(jìn)入,影響消毒效果和損壞玻璃器皿或發(fā)生意外事故。在滅菌時,物品不能放的太擠。
滅菌的玻璃器皿中不可有水,有水的玻璃器皿在干熱滅菌時容易炸裂。培養(yǎng)基、橡膠制品、塑料制品不能用此方法消毒。
(2)濕熱滅菌:在相同溫度下,濕熱的滅菌效力比干熱滅菌好。原因是:(1)熱蒸汽對細(xì)胞成分的破壞作用更強(qiáng)。
水分子的存在有助于破壞維持蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的氫鍵和其他相互作用弱鍵,更易使蛋白質(zhì)變性。加熱使蛋白質(zhì)變性,與水的含量有關(guān),當(dāng)環(huán)境和細(xì)胞含水量越大,凝固越快。
蛋白質(zhì)含水量與其凝固溫度成反比;(2)熱蒸汽比熱空氣穿透力強(qiáng),能更有效地殺滅微生物;(3)蒸汽存在潛能,當(dāng)氣體轉(zhuǎn)變成液體時可放出大量熱能,故可更迅速提高滅菌物體的溫度。濕熱滅菌常用的方法有高壓蒸汽滅菌、常壓蒸汽滅菌和煮沸滅菌。
其中高壓蒸汽滅菌法最為常用,效果最好。常壓蒸汽滅菌法不能在短時間內(nèi)殺死細(xì)菌芽孢,必須采取間歇滅菌或持續(xù)滅菌的方法,才能達(dá)到完全滅菌。
而煮沸滅菌僅用于注射器及某些用具的滅菌,被滅菌物品的濕度太大。所以,這兩種方法較少使用。
高壓蒸氣滅菌是在密閉的高壓蒸汽鍋中進(jìn)行的。其原理是:將待滅菌的物體放置在盛有適量水的高壓蒸汽滅菌鍋內(nèi),將鍋內(nèi)的水加熱煮沸,并把其中原有的冷空氣徹底驅(qū)盡后將鍋密閉,再繼續(xù)加熱就會使鍋內(nèi)的蒸汽壓逐漸上升,從而使溫度也隨之上升到100℃以上。
滅菌時,根據(jù)不同的物品選擇不同壓力和時間,一般物品(如布類、金屬器械、玻璃器皿等)消毒的要求是0.15MPa下15min,培養(yǎng)液和橡膠制品為0.1MPa下10min。滅菌前在鍋內(nèi)加適量的水,加水過少,易將滅菌鍋燒干,引起炸裂事故。
加水過多有可能引起滅菌物品浸水。物品不能裝得過滿,以免影響消毒器內(nèi)氣體流通。
導(dǎo)氣管要伸至罐底并防止堵塞。在加熱升壓之前,先要打開排氣閥門排放消毒器內(nèi)的冷空氣,冷空氣排出后,關(guān)閉排氣閥門,同時檢驗安全閥活動自如,開始升壓,當(dāng)達(dá)到所需壓力時,開始計時,并控制壓力恒定。
滅菌過程中,操作者不能離開工作崗位,要定時檢查壓力及安全,防止意外事件發(fā)生。滅菌完畢后一定要先打開閥門放氣,當(dāng)滅菌鍋內(nèi)壓力下降到“0”時,再打開滅菌鍋的蓋。
也可在滅菌完畢后,關(guān)閉電源總閥,讓滅菌物品自然冷卻,待滅菌鍋壓力表降至“0”時,再取出滅菌物品。蒸汽壓力與溫度的關(guān)系 蒸汽壓力(表壓) 蒸汽溫度 Kg/cm2 MPa ℃ ℉0.00 0.00 100 2120.25 0.025 107.0 2240.50 0.050 112.0 2340.75 0.075 115.5 2401.00 0.100 121.0 2501.50 0.150 128.0 2622.00 0.200 134.5 274 (3)紫外線殺菌: 紫外線的波長范圍是200?300nm,殺菌范圍為240?280nm,其中波長在260nm左右的紫外線殺菌作用最強(qiáng)。
紫外燈是人工制造的低壓水銀燈,能輻射出257.3nm的紫外線,殺菌能力強(qiáng)且較穩(wěn)定。紫外線殺菌作用是因為它可以被蛋白質(zhì)(波長為280nm)和核酸(波長為260nm)吸收,造成這些分子的變性失活。
紫外線穿透能力很差,不能穿透玻璃、衣物、紙張和大多數(shù)其他物體,但能穿透空氣,主要用于實驗室空氣、操作臺表面和不能使用其它方法進(jìn)行滅菌的物品。紫外線直接照射方便、效果好,經(jīng)一定的時間照射后,可以消滅空氣。
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