重組質(zhì)粒構建是常用的分子生物學手段,其實只是最基本的方法,一般一個星期同時構建三二個組質(zhì)粒是沒有問題的。在國內(nèi)先進的實驗中,也大都是由實驗員搞定。但是其中還是有些基本的技巧需要掌握。在這里將我的心得分享于大家,這也是我本人幾年來一線工作時的經(jīng)驗積累,以期能為谷友提供借鑒,讓大家在實驗中少走彎路。所涉及內(nèi)容如下:
1) 克隆基因的酶切位點問題
2) 載體酶切的問題
3) 連接片段濃度比的問題
在闡明上述問題同時,本人盡可能舉些實驗中的問題案例予以說明。
一、克隆基因的酶切位點問題
1、克隆位點選擇的問題。首先要對目標基因進行酶切位點掃描分析,列出其所含酶切位點清單。然后對照質(zhì)粒多克隆位點,所選擇的克隆位點必須是目標基因所不含的酶切位點。這是常識,不贅述。
2、保護堿基數(shù)目的問題。在設計PCR引物時,引入酶切位點后,常常要加入保護堿基,這是大家所熟知的。但是保護堿基數(shù)量多少,可能被新手所忽視。這種忽視碰可能會大大影響后續(xù)的實驗進展。
一般情況下,普通的內(nèi)切酶只加入兩個保護堿基,其內(nèi)切反應就可以正常進行;而有一類,僅僅只加入兩個保護堿基,其內(nèi)切反應就不能正常進行,這是因為內(nèi)切酶不能正常結合DN段上。如NdeI就屬這類,需要加入至少6個保護堿基,常用的HindIII也要三個。
1.電擊轉(zhuǎn)化時通過瞬時高壓使細胞表面出現(xiàn)微小的孔洞,從而使外源DNA能通過孔洞進入到細胞里面,一般適用于革蘭氏陽性細菌或者真核微生物;
熱激轉(zhuǎn)化是使用鈣鹽或者鎂鹽溶液在低溫狀態(tài)下處理細胞使其處于感受態(tài)狀態(tài),然后通過短時熱激使其吸入外源DNA片段,主要應用于革蘭氏陰性細菌。
這些我想你應該懂的。我就不贅述了。
2.大腸桿菌作為革蘭氏陰性細菌,使用一般的化學轉(zhuǎn)化即熱激轉(zhuǎn)化就可以了,為何要勞神費力使用電轉(zhuǎn)化?轉(zhuǎn)化的目的不就是簡單而方便為原則么?正所謂殺雞焉用牛刀?
希望我的回答對你有幫助。
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