單核苷酸多態(tài)性(單核苷酸多態(tài)性的介紹)
1.單核苷酸多態(tài)性的介紹
單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism,SNP），主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。SNP在人類基因組中廣泛存在，平均每500~1000個堿基對中就有1個，估計其總數(shù)可達300萬個甚至更多。
2.什么是單核苷酸多態(tài)性（SNP）
單核苷酸多態(tài)性主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種，占所有已知多態(tài)性的80%以上。
SNP在人類基因組中廣泛存在，平均每500?1000個堿基對中就有1個，估計其總數(shù)可達300萬個甚至更多。SNP是一種二態(tài)的標記，由單個堿基的轉(zhuǎn)換或顛換所引起，也可由堿基的插入或缺失所致。SNP既可能在基因序列內(nèi)，也可能在基因以外的非編碼序列上。
擴展資料：
在遺傳學分析中， SNP 作為一類遺傳標記得以廣泛應用， 主要源于這幾個特點：
(1)密度高
SNP在人類基因組的平均密度估計為 1\1000 bp ， 在整個基因組的分布達 3*106個，遺傳距離為 2~3cM ， 密度比微衛(wèi)星標記更高， 可以在任何一個待研究基因的內(nèi)部或附近提供一系列標記。
(2)富有代表性
某些位于基因內(nèi)部的SNP 有可能直接影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或表達水平， 因此， 它們可能代表疾病遺傳機理中的某些作用因素。SNP自身的特性決定了它更適合于對復雜性狀與疾病的遺傳解剖以及基于群體的基因識別等方面的研究。
(3)遺傳穩(wěn)定性
與微衛(wèi)星等重復序列多態(tài)性標記相比， SNP 具有更高的遺傳穩(wěn)定性。
(4)易實現(xiàn)分析的自動化
SNP標記在人群中只有兩種等位型（allele） 。這樣在檢測時只需一個“ + \- ”或“全\無”的方式，而無須象檢測限制性片段長度多態(tài)性，微衛(wèi)星那樣對片段的長度作出測量，這使得基于SNP的檢測分析方法易實現(xiàn)自動化。
參考資料來源：百度百科-單核苷酸多態(tài)性
3.什么是單核苷酸多態(tài)性
單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs），即指由于單個核苷酸堿基的改變而導致的核酸序列的多態(tài)性，一般認為SNP與點突變的區(qū)別在于SNP出現(xiàn)頻率高于1%.人類基因組中總共有300萬個SNP，平均每1000個堿基中就有一個SNP.SNP的分布不均勻，非轉(zhuǎn)錄區(qū)要多于轉(zhuǎn)錄區(qū)，大多數(shù)位于蛋白的非編碼區(qū).SNP是人類基因組中密度最大的遺傳標記，發(fā)生頻率較高，被認為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學標記.在醫(yī)學遺傳學、藥物遺傳學、疾病遺傳學、疾病診斷學、以及人類進化等研究領(lǐng)域都有著很高的研究價值和應用前景。
4.聚焦單核苷酸多態(tài)性是什么
聚焦單核苷酸多態(tài)性，使舒尼替尼個體化治療更進一步。
建立單核苷酸多態(tài)性（SNP）療效預測模型 SNP遍布于整個人類基因組中，是指同一物種不同個體基因組DNA的等位序列上單個核苷酸存在差異的現(xiàn)象。SNP決定了個體差異，研究顯示其與個體人群對腫瘤的易感性相關(guān)。
例如，BRCA1基因的SNP與30%乳腺癌發(fā)病相關(guān)；RET基因外顯子634的SNP與85%的髓樣甲狀腺癌相關(guān)，因而在有家族性甲狀腺癌病史的青年女性中，如表達RET外顯子634，目前甚至推薦進行預防性甲狀腺切除。 研究已顯示，SNP可預測抗腫瘤藥物的療效和不良反應。
例如UGT1A1作為伊立替康重要的藥物代謝酶，其基因的SNP可顯著影響該酶的活性，進而可預測伊立替康治療結(jié)直腸癌的不良反應。歐洲研究證實，對于白種人，UGT1A1*28 6/6基因型患者接受伊立替康治療的中位OS更長，血液學毒性作用發(fā)生率更低，因毒性作用住院和短期死亡的患者比例也更低。
基于這些結(jié)果，研究者希望進一步開展SNP的相關(guān)研究，建立SNP的相關(guān)療效預測模型。 SNP與舒尼替尼 舒尼替尼是一種口服酪氨酸激酶受體抑制劑，作用于血小板衍生生長因子受體（PDGFR）&alPHa；及β、血管內(nèi)皮細胞生長因子受體（VEGFR）1~ 3、KIT、FLT 3、CSF-1R、RET等多個靶點。
一方面作用于腫瘤細胞，促進腫瘤細胞凋亡，阻斷細胞增殖，另一方面作用于血管內(nèi)皮細胞，抑制腫瘤新生血管生成，從而達到抗腫瘤的作用。 SNP是否與舒尼替尼治療腎癌的療效及毒性作用之間具有相關(guān)性？2011年西班牙學者發(fā)表在《柳葉刀·腫瘤》（Lancet oncol 2011,12:1143）的一項多中心、觀察性、前瞻性研究利用9個基因的16個關(guān)鍵多態(tài)性，即VEGFR2(rs2305948和rs1870377)、VEGFR3(rs30782 6、rs448012和rs307821)、PDGFR&alPHa;(rs35597368)、VEGF-A(rs201096 3、rs699947和rs1570360)、IL8(rs1126647)、CYP3A4(rs2740574)、CYP3A5(rs776746)、ABCB1(rs104564 2、rs1128503和rs2032582)和ABCB2(rs2231142)，評價了SNP作為101例晚期RCC患者接受舒尼替尼一線治療的療效和毒性預測指標的效果。
結(jié)果顯示，VEGFR3基因的2個多態(tài)性位點rs307826和rs307821與PFS顯著相關(guān)。在rs307826方面，與VEGFR3基因rs307826 AG（雜合子）患者相比，VEGFR3 rs307826 AA（野生型）患者的中位PFS期顯著更長（13。
7個月對3。6個月，圖），疾病進展風險下降72%;AA中約30%患者的PFS超過40個月，而AG患者在約15個月的時間內(nèi)均出現(xiàn)了疾病進展。
而且，更為有趣的是，研究中AA患者的比例為83。1%，舒尼替尼治療的DCR恰好為84%，這提示舒尼替尼可能對AA患者更為有效。
在rs307821方面，與rs307821 GT（雜合子）患者相比，rs307821 GG（野生型）患者的中位PFS期更長（13。7個月對6。
7個月），疾病進展風險顯著下降。此外，研究還發(fā)現(xiàn)，CYP3A5基因多態(tài)性與因毒性反應致舒尼替尼用藥減量的風險增加存在相關(guān)性。
與CYP3A5 rs776746 AG相比，CYP3A5 rs776746 GG患者因毒性反應減少劑量的風險顯著下降。研究者認為，CYP3A5*1基因多態(tài)性影響CYP3A5酶的表達，CYP3A5與CYP3A4具有相同的底物特異性，CYP3A4是催化舒尼替尼代謝的關(guān)鍵酶。
因此CYP3A5*1能代謝舒尼替尼，導致活性產(chǎn)物和長效代謝產(chǎn)物SU12662增加，產(chǎn)生毒性作用。值得一提的是，不同民族的CYP3A5 rs776746等位基因頻率存在很大差異，該等位基因更常見于非洲人或亞洲人，這可能部分解釋了研究報告中亞洲人群接受舒尼替尼治療毒性反應較高的潛在原因。
基于目前的研究結(jié)果可見，VEGFR3和CYP3A5的基因多態(tài)性可能作為舒尼替尼治療晚期療效和毒性作用的分子預測指標。如果這些研究結(jié)果能在不僅涉及高加索人群，也在涉及亞洲人群的國際多中心隨機臨床研究中得到證實，將有助于相關(guān)干預性研究的開展和患者的篩選，從而使腎癌的個體化治療不斷向前發(fā)展。
